Integrated Genome Browser
| Version |
9 |
| Plattforms | |
| Lizenz | Open Source |
| Kategorie | Scientific |
| Mehr Info
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Software-Überprüfung
Hauptfunktionen
- Unterstützt verschiedene Genomformate wie GenBank und FASTA
- Interagieren Sie mit Daten mit Zoom- und Schwenkanimationen
- Genome von QuickLoad-Sites aus aufrufen und laden
- Daten in verschiedene Diagrammformen umwandeln
- Daten mit Kollegen über Dropbox teilen
- Installieren Sie Plugins für zusätzliche Funktionen
Der Integrated Genome Browser (IGB) ist ein Open-Source-Programm zum Anzeigen und Durchsuchen großer genomischer Datensätze. Sie können verschiedene Datenformate anzeigen, mit Ihren Daten interagieren, Diagramme erstellen, Ihre Informationen als Bilder speichern und Ihre Daten für andere Mitarbeiter freigeben.
Mit IGB können Sie Daten aus Anmerkungen und aneinandergereihten Sequenzen anzeigen. Das Programm unterstützt eine Vielzahl von Formaten wie FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband und GenBank. Sie können Daten übernehmen und in eine Vielzahl von Diagrammformen umwandeln, einschließlich nicht übereinstimmender Diagramme zum Hervorheben von Datenunterschieden und Tiefengrafiken zum Anzeigen der Abdeckung. Sie können auch mit Ihren Daten über IGBs Zoom- und Schwenkanimationen interagieren.
Mit IGB können Sie Genome von QuickLoad-Sites aus aufrufen und laden. Dies sind einfache Systeme von Verzeichnissen, Sequenzen und anderen Datendateien für Visualisierungszwecke. IGB bietet erweiterte Funktionen mit Plugin-Unterstützung, um durch die Verwendung von Skripts Funktionen und Workflow-Automatisierung hinzuzufügen. IGB bietet Ihnen außerdem erweiterte Funktionen zum Freigeben Ihrer Daten, sei es als hochqualitative JPEG-, PNG- oder SVG-Bilder oder zum Speichern von Daten in Dropbox, um Ihren Mitarbeitern Zugriff auf Ihr Projekt zu gewähren.
IGB ist hauptsächlich von Universitätsforschern, Biologen und Bioinformatikern verwendet. Es bietet erweiterte Tools zum Öffnen einer Vielzahl von Genom-Datenformaten, zum Visualisieren von Daten als verschiedene Diagramme und zur gemeinsamen Nutzung von Daten mit Mitarbeitern. Leider stützt sich das Programm auf Zuschüsse für die weitere Entwicklung, so dass die Unterstützung für den Antrag jederzeit eingestellt werden kann. Integrated Genome Browser ist jedoch immer noch ein fähiges, anpassbares Programm für Benutzer, die ihre Genomdaten untersuchen und analysieren möchten.
Aktualisiert: 29. Juni 2016
▶ Andere Dateierweiterungen verwendet Integrated Genome Browser 9
| Unterstützte Dateitypen | |
|---|---|
| .BED | UCSC BED Annotation Track File |
| .GB | GenBank Data File |
| .FASTA | FASTA Sequence File |
| .DAS | DeltaMaster Analysis Session |
| .SGR | SGR Genome Data File |
| .FA | FASTA Formatted Sequence File |
| .USEQ | USeq Genome Data File |
| Zusätzliche verwandte Dateiformate |
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