.cram Dateierweiterung
Dateityp Compressed Alignment File
| Entwickler | EBI |
| Kategorie | Datei |
| Datei Formatieren | Binary |
Was ist eine CRAM Datei?
Komprimiertes Ausrichtungsdateiformat, entwickelt von EBI, einer Außenstelle des Europäischen Labors für Molekularbiologie; speichert kurze DNA-Sequenz-Lese-Alignments, die von kurzen Read-Alignern wie BWA, BBMap und BLAT erzeugt wurden.
Das CRAM-Dateiformat ähnelt dem Dateiformat Binary Alignment / Map (BAM), weist jedoch eine bessere Dateikomprimierung und ein umstrukturiertes spaltenorientiertes binäres Containerformat auf. Da das Datenvolumen im Bereich der genetischen Software zunimmt, wurde das CRAM-Format entwickelt, um den Speicherbedarf der Ausrichtungsdaten zu verringern.
Short Read Alignment ist der Prozess der Entschlüsselung, woher eine Sequenz im Genom kommt. Dies kann schwierig sein, da das Referenzgenom ziemlich groß ist und Sie nicht immer nach genauen Übereinstimmungen im Referenzgenom suchen. Short Read Aligner werden verwendet, um riesige Sequenzen nach Übereinstimmungen und Übereinstimmungen zu durchsuchen. Da die Sequenzen so groß sind, ist eine Komprimierung durch Formate wie CRAM erforderlich, um die Dateigrößen überschaubar zu halten.
Programme, die CRAM Dateien öffnen können
| Windows |
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